91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1955 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  100 
 
 		 389 aa  787    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  53.52 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  46.38 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  47.49 
 
 		 391 aa  322  8e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  38.19 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  43.77 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  67.35 
 
 		 216 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  67.35 
 
 		 249 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  67.35 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  64.35 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  60.19 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  66.67 
 
 		 239 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  51.08 
 
 		 209 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  59.65 
 
 		 238 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  63.73 
 
 		 222 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  59.05 
 
 		 164 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  59.62 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  32.82 
 
 		 328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  52 
 
 		 196 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  50.36 
 
 		 263 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  35.86 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  59.05 
 
 		 227 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  32.6 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  60.42 
 
 		 232 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  32.84 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  31.56 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  54.46 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  61.54 
 
 		 225 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  51.75 
 
 		 145 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  29.82 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  29.67 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  28.01 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  53.27 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  55.88 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  52.88 
 
 		 243 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  50.98 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  27 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  58.82 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  54.64 
 
 		 348 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  29.37 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  53.49 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  31.17 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  27.47 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  58.75 
 
 		 282 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  30.46 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  28.63 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  29.44 
 
 		 340 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  26.5 
 
 		 461 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  31.66 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  30.23 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  26.5 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  46.99 
 
 		 194 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  25.8 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  29.1 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  28.72 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  23.43 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  24.19 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  24.34 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  26.46 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  30.68 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  22.05 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  28.5 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  25.93 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  25.93 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  23.51 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  29.91 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  26.96 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  23.44 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  21.54 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  26.29 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  24.87 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  26.56 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  27.82 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  25.8 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  21.45 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  25.8 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  25.8 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  29.2 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  27.87 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  34.74 
 
 		 1995 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  32.67 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  29.23 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  30.39 
 
 		 482 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  34.67 
 
 		 520 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  34.67 
 
 		 518 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  22.22 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  30.11 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  28.99 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>