85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  53.37 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  51.79 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  47.46 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  37.17 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  45.49 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  68.27 
 
 		 216 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  70.83 
 
 		 249 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  67.68 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  38.69 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  66.34 
 
 		 238 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  64 
 
 		 209 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  58.65 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  62.75 
 
 		 234 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  63.64 
 
 		 222 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  60.58 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  62.89 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  61.46 
 
 		 164 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  62 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  35.71 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  60.42 
 
 		 232 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  59.79 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  59.38 
 
 		 227 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  31.28 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  58.33 
 
 		 196 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  30.32 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  33.1 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  62.22 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  60 
 
 		 220 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  50.47 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  51.89 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  29.86 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  31.37 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  56.44 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  52.38 
 
 		 243 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  53.54 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  31.56 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  57.65 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  31.9 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  29.94 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  49 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  31.98 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  31.37 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  31.56 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  50 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  32.85 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  30.62 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  29.87 
 
 		 461 aa  96.3  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  29.84 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  52.44 
 
 		 282 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  27.6 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  30.67 
 
 		 547 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  27.92 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  29.47 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  29.47 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  29.47 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  31.72 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  23.7 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  32.36 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  29.96 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  29.96 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  25.34 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  25.93 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  48.78 
 
 		 194 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  28.3 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  30.6 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  30.05 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  25.35 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  28.91 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.4 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  23.68 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  30.95 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  28.46 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  40 
 
 		 1995 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  23.18 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  26.19 
 
 		 342 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  24.41 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  30.91 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  35.48 
 
 		 338 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  25.71 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  23.08 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  23.38 
 
 		 275 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>