45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0347 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  60.4 
 
 
398 aa  131  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  59.18 
 
 
467 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  55.34 
 
 
448 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  52.88 
 
 
460 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  56.44 
 
 
412 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  55.34 
 
 
389 aa  114  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  60.92 
 
 
359 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  56.98 
 
 
391 aa  108  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  57.73 
 
 
216 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  52.53 
 
 
272 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  54.64 
 
 
249 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  49.06 
 
 
280 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  55.66 
 
 
238 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  55.45 
 
 
243 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  53.12 
 
 
196 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  51.52 
 
 
145 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  48.57 
 
 
164 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  52.04 
 
 
348 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  59.52 
 
 
445 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  54.64 
 
 
220 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  54.35 
 
 
263 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  57.14 
 
 
258 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  57.14 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  50 
 
 
209 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  51.46 
 
 
234 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  52.08 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  51.55 
 
 
451 aa  97.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  41.89 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  59.21 
 
 
479 aa  94.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  63.01 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  63.77 
 
 
232 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  51.19 
 
 
331 aa  92.8  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  51.19 
 
 
328 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  48.75 
 
 
282 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  37.86 
 
 
1995 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  39.8 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1529  hypothetical protein  34.94 
 
 
137 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.210241 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  49.02 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  54.9 
 
 
512 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
619 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
619 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.62 
 
 
574 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.15 
 
 
655 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  40.26 
 
 
222 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>