37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0139 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  67.37 
 
 		 282 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  56.25 
 
 		 249 aa  88.6  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  43.28 
 
 		 145 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  39.69 
 
 		 451 aa  85.1  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  53.75 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  51.85 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  44.76 
 
 		 467 aa  82  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  51.22 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  49.48 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  51.25 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  44.44 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  47.56 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  45.1 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  51.9 
 
 		 1995 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  46.88 
 
 		 445 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  46.99 
 
 		 389 aa  75.1  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  48.81 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  48.78 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  42.24 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  48.75 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  48.15 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  51.95 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  47.5 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  45.56 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  42.05 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  45.12 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  41.76 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  40.48 
 
 		 448 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  46.58 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  40.7 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  43.04 
 
 		 479 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  34.18 
 
 		 331 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  38.36 
 
 		 460 aa  41.6  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>