37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2200 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  55.33 
 
 
164 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  64.95 
 
 
216 aa  138  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  57.73 
 
 
239 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  68.67 
 
 
249 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  59.79 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  58.76 
 
 
359 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  62.64 
 
 
222 aa  127  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  54.64 
 
 
209 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  62.64 
 
 
272 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  61.86 
 
 
445 aa  123  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  70 
 
 
467 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  62.22 
 
 
227 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  65.06 
 
 
391 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  51.75 
 
 
389 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  61.11 
 
 
225 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  64.2 
 
 
232 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  65.85 
 
 
238 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  56.38 
 
 
220 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  55.67 
 
 
243 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  59.76 
 
 
451 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  57.78 
 
 
258 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  60.24 
 
 
398 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  56 
 
 
234 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  66.23 
 
 
263 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  52.99 
 
 
196 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  56.25 
 
 
348 aa  104  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  50 
 
 
231 aa  103  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  50.52 
 
 
448 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  53.09 
 
 
280 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  51.22 
 
 
479 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  46.36 
 
 
460 aa  91.3  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  55 
 
 
194 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  53.09 
 
 
282 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  46.25 
 
 
331 aa  80.5  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  46.25 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  42.67 
 
 
1995 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>