38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1108 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  70.83 
 
 		 412 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  67.35 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  68.37 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  57.81 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  68.37 
 
 		 467 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  68.75 
 
 		 389 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  70 
 
 		 398 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  70.11 
 
 		 391 aa  148  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  62.63 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  60.82 
 
 		 451 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  54.81 
 
 		 164 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  58.59 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  69.41 
 
 		 445 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  59.6 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  65.88 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  62.5 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  47.97 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  68.67 
 
 		 145 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  65.88 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  60 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  47.65 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  61.05 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  55.21 
 
 		 448 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  59.34 
 
 		 196 aa  122  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  58.82 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  57.5 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  56.82 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  43.85 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  51.69 
 
 		 460 aa  102  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  52.33 
 
 		 479 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  60.49 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  47.5 
 
 		 280 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  49.43 
 
 		 331 aa  89.4  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  56.25 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  49.37 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  40.43 
 
 		 1995 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  26.57 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>