37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0869 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  74.68 
 
 		 225 aa  331  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  45.76 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  57.04 
 
 		 451 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  65.31 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  72.41 
 
 		 391 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  65.31 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  59.6 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  57.55 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  60.61 
 
 		 209 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  60.71 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  71.76 
 
 		 398 aa  135  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  55.56 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  58.88 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  60.42 
 
 		 412 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  57.58 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  57.89 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  57.73 
 
 		 164 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  60.42 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  64.2 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  60 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  58.82 
 
 		 445 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  52.04 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  49.44 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  47.92 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  48.98 
 
 		 196 aa  99.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  62.86 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  56.16 
 
 		 460 aa  93.6  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  50.59 
 
 		 479 aa  93.2  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  50.59 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  54.32 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  50.59 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  46.34 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  42.68 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  45.98 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  38.57 
 
 		 1995 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>