71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1867 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  100 
 
 
212 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  35.21 
 
 
184 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  34.26 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0593  hypothetical protein  50.65 
 
 
127 aa  72  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  29.79 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  31.13 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  52.05 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  30.94 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  47.44 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1547  aggregation promoting factor-like surface protein  35.11 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149607  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0696  aggregation promoting factor-like surface protein  46.15 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000939064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  35.04 
 
 
474 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  33.9 
 
 
474 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  29.63 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  48 
 
 
509 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  34.69 
 
 
474 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1546  aggregation promoting factor-like surface protein  40.59 
 
 
307 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000247102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  31.19 
 
 
293 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
250 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  46.51 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  46.34 
 
 
128 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  33.6 
 
 
466 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  34.52 
 
 
751 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  39.34 
 
 
511 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.19 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.89 
 
 
327 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  48.78 
 
 
568 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 
132 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  40.3 
 
 
395 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  37.23 
 
 
323 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 
109 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  29.7 
 
 
340 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  34 
 
 
265 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  34 
 
 
265 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  25.95 
 
 
279 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  38.96 
 
 
305 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  31.34 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.59 
 
 
797 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.18 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  37.25 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  34.94 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
409 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  45.24 
 
 
661 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  32.86 
 
 
424 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  32.05 
 
 
471 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  39.02 
 
 
560 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 
590 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  37.65 
 
 
359 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  30.95 
 
 
390 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  53.49 
 
 
372 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  27.78 
 
 
285 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  29.2 
 
 
534 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 
368 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0324  muramidase  49.3 
 
 
436 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  32.73 
 
 
175 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  27.87 
 
 
610 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  28.18 
 
 
499 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  35.37 
 
 
282 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 
556 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 
522 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  29.93 
 
 
285 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  31.17 
 
 
445 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  42.86 
 
 
284 aa  42  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  30 
 
 
483 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.58 
 
 
472 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
341 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  37.93 
 
 
205 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  39.53 
 
 
411 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  31.08 
 
 
159 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>