53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0415 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  57.02 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  51.35 
 
 		 253 aa  171  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  53.12 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1547  aggregation promoting factor-like surface protein  78.22 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1546  aggregation promoting factor-like surface protein  77.32 
 
 		 307 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000247102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  41.54 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  57.75 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  35.44 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  35.02 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  40.78 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0696  aggregation promoting factor-like surface protein  52.05 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000939064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  48.15 
 
 		 568 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.77 
 
 		 954 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 539 aa  51.6  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 590 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  54.72 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  35.06 
 
 		 301 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1913  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  49.06 
 
 		 298 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  41.98 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  34.31 
 
 		 367 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  30.47 
 
 		 272 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 132 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  32.69 
 
 		 293 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 		 333 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 307 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 330 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  46.03 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  34.72 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  37.84 
 
 		 414 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  37.66 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  51.02 
 
 		 434 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  45.83 
 
 		 520 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  44.62 
 
 		 509 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  39.68 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  45.45 
 
 		 456 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  34.38 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  38.81 
 
 		 387 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0593  hypothetical protein  38.96 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 		 560 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  29.11 
 
 		 230 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  26.79 
 
 		 340 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 		 546 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  38 
 
 		 264 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 168 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  44 
 
 		 465 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 409 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 754 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 128 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 335 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  31.19 
 
 		 335 aa  41.2  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>