149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2148 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  58.76 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1547  aggregation promoting factor-like surface protein  50.36 
 
 		 261 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1546  aggregation promoting factor-like surface protein  55.14 
 
 		 307 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000247102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  39.3 
 
 		 235 aa  111  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  69.88 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  39.27 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  61.97 
 
 		 289 aa  86.3  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  32.98 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  39.47 
 
 		 499 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  31.13 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  63.64 
 
 		 372 aa  54.7  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.31 
 
 		 568 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  43.33 
 
 		 424 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 709 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  30.36 
 
 		 323 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  36.25 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  54.55 
 
 		 390 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  27.93 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0889  LysM domain-containing protein  50 
 
 		 253 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000446725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 341 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 466 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  42.19 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  51.11 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  51.16 
 
 		 274 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.62 
 
 		 242 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.7 
 
 		 448 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  37.97 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  45.45 
 
 		 372 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  45.45 
 
 		 372 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  55.56 
 
 		 429 aa  48.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 109 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  41.67 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  41.67 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  39.02 
 
 		 395 aa  47.8  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.79 
 
 		 954 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  33.03 
 
 		 754 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  53.49 
 
 		 520 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 440 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  48.94 
 
 		 361 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1186  Slt family transglycosylase  48.89 
 
 		 398 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  34.41 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 744 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  31.11 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  41.67 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  44.07 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  44.07 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  40.43 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  40.82 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  44.07 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 567 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  44.07 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  32.32 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  44.07 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  41.67 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  48.89 
 
 		 517 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 503 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.67 
 
 		 236 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 474 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  31.25 
 
 		 739 aa  45.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  39.58 
 
 		 233 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  44.68 
 
 		 367 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  47.92 
 
 		 515 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  38.18 
 
 		 286 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  31.25 
 
 		 739 aa  45.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  29.9 
 
 		 751 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  44.64 
 
 		 384 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  47.92 
 
 		 515 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  47.92 
 
 		 515 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  30 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  45.28 
 
 		 250 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  34.67 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  34.25 
 
 		 314 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 301 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  41.38 
 
 		 315 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  47.92 
 
 		 515 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  41.38 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  27.63 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  38.78 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  44.9 
 
 		 445 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  53.66 
 
 		 283 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.38 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.38 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.38 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.38 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.38 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 567 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  48.94 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  48.94 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  39.13 
 
 		 602 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  48.94 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  39.58 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  39.51 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  39.58 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.58 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.58 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 423 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>