83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2149 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 709 aa  1456    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_38  putative cell wall degradation protein  24.7 
 
 		 814 aa  90.9  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  26.6 
 
 		 744 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1192  hypothetical protein  24.93 
 
 		 887 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  41.43 
 
 		 1225 aa  65.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2629  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1101 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04701  DNA repair ATPase  26.15 
 
 		 975 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  50 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  44.59 
 
 		 341 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 327 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  42.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  52.27 
 
 		 338 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  57.78 
 
 		 372 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  57.78 
 
 		 372 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 142 aa  54.3  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.45 
 
 		 75 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.67 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 307 aa  52.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  54.17 
 
 		 175 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 		 207 aa  50.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  57.45 
 
 		 179 aa  50.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.06 
 
 		 175 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 399 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  44.64 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 191 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  40 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  30.95 
 
 		 305 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.92 
 
 		 470 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 97 aa  49.3  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 567 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 334 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0266  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1100 aa  48.9  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0987529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  48.89 
 
 		 491 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  45.1 
 
 		 161 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  45.65 
 
 		 284 aa  48.5  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  45.1 
 
 		 161 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  52.08 
 
 		 440 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 390 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1881  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.5 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210829  decreased coverage  0.000286942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 156 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  53.19 
 
 		 216 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.67 
 
 		 376 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  56.25 
 
 		 568 aa  47  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.85 
 
 		 590 aa  47.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 411 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  34.18 
 
 		 287 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  45.83 
 
 		 324 aa  46.6  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.77 
 
 		 954 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  39.34 
 
 		 739 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 520 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  46 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 145 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.89 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  54.76 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.68 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 		 443 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 145 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 158 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.9 
 
 		 274 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.83 
 
 		 230 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  47.73 
 
 		 390 aa  45.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  54.76 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 337 aa  45.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 123 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  42.86 
 
 		 423 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 109 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  47.73 
 
 		 351 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 567 aa  45.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  58.33 
 
 		 739 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  46.67 
 
 		 264 aa  44.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  44.19 
 
 		 479 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  44 
 
 		 160 aa  44.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 530 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  45.83 
 
 		 420 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 295 aa  44.3  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 130 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  47.83 
 
 		 334 aa  44.3  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  45.65 
 
 		 445 aa  43.9  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  47.83 
 
 		 334 aa  44.3  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  51.11 
 
 		 372 aa  43.9  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>