39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0648 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
1225 aa  2434    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  28.27 
 
 
1174 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  41.43 
 
 
709 aa  65.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  29.03 
 
 
1126 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  38.46 
 
 
203 aa  53.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 
142 aa  53.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  44.68 
 
 
520 aa  52  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  37.5 
 
 
205 aa  52  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  27.42 
 
 
1132 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.54 
 
 
327 aa  51.6  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  27.81 
 
 
1142 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  45.83 
 
 
621 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  45.83 
 
 
609 aa  49.3  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  45.83 
 
 
587 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 
744 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  45.83 
 
 
615 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  45.83 
 
 
613 aa  49.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 
207 aa  48.9  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  27.4 
 
 
1146 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  45.65 
 
 
674 aa  48.5  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  35.63 
 
 
194 aa  48.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  44.68 
 
 
520 aa  48.5  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40 
 
 
335 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
341 aa  48.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  45.65 
 
 
631 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 
307 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  45.65 
 
 
604 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  26.43 
 
 
1173 aa  46.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
466 aa  46.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
197 aa  46.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  43.48 
 
 
432 aa  45.8  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  43.75 
 
 
267 aa  45.8  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  43.48 
 
 
721 aa  45.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.67 
 
 
470 aa  45.8  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  27.86 
 
 
573 aa  45.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  42.31 
 
 
157 aa  45.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  38 
 
 
424 aa  45.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  44 
 
 
158 aa  45.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  39.71 
 
 
333 aa  44.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>