More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0300 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  68.69 
 
 
203 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  61.42 
 
 
328 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  48.04 
 
 
275 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  48.85 
 
 
275 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  48.86 
 
 
270 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  48.85 
 
 
275 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  48.04 
 
 
275 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  48.85 
 
 
275 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  48.85 
 
 
275 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  52.29 
 
 
263 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  48.3 
 
 
270 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  58.59 
 
 
300 aa  158  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  60.94 
 
 
244 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  59.68 
 
 
283 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  58.06 
 
 
276 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  56.59 
 
 
245 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  53.6 
 
 
321 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  39.23 
 
 
290 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  45.71 
 
 
280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  42.86 
 
 
258 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  35.62 
 
 
214 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  51.69 
 
 
300 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  49.25 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  42.54 
 
 
270 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.62 
 
 
129 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  46.77 
 
 
274 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  39.31 
 
 
242 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  38.38 
 
 
458 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  48.78 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  40.48 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.63 
 
 
444 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  47.5 
 
 
264 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  46.32 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  44.54 
 
 
338 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  38.41 
 
 
261 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  43.24 
 
 
226 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  43.7 
 
 
180 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  45.38 
 
 
495 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  45 
 
 
541 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  43.26 
 
 
465 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  44.35 
 
 
212 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  45.45 
 
 
450 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  44.54 
 
 
317 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  42.65 
 
 
254 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  47.46 
 
 
211 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  43.8 
 
 
255 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  40.94 
 
 
275 aa  99.4  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.46 
 
 
443 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  45.08 
 
 
287 aa  98.6  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  45.53 
 
 
410 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  41.18 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  43.31 
 
 
232 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.5 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  44 
 
 
500 aa  94.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.17 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1623  SCP-like extracellular  39.55 
 
 
259 aa  92  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.015038  hitchhiker  0.000000394389 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  41.74 
 
 
287 aa  91.3  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  41.74 
 
 
287 aa  91.3  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  38.02 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  34.9 
 
 
373 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  44.17 
 
 
260 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  41.18 
 
 
285 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40 
 
 
156 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
347 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  43.65 
 
 
317 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  37.9 
 
 
341 aa  89  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  43.65 
 
 
317 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  34.9 
 
 
336 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  34.66 
 
 
196 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  35.77 
 
 
353 aa  85.5  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  34.9 
 
 
344 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  35.16 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  38.24 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  38.02 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  34.23 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  39.34 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  35.88 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  40.98 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  30.07 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  34.34 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  35.19 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  31.94 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  33.6 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  32 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  35.94 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.19 
 
 
322 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  31.65 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  38.61 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  35.71 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 
310 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  36.92 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>