161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1331 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  758    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  758    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0913  CHAP domain-containing protein  46.43 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.032593  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0931  CHAP domain-containing protein  46.43 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0367  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.06 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0376  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.06 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1080  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.06 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1101  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.06 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.299401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2003  CHAP domain-containing protein  35.04 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.115829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2038  CHAP domain-containing protein  35.04 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000312263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  58.14 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 590 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  59.09 
 
 		 75 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  47.27 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  57.78 
 
 		 709 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  29.59 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  29.41 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  53.06 
 
 		 205 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  39.51 
 
 		 744 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  32.12 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.43 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  42.86 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  53.49 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  44.74 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  54.35 
 
 		 661 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  48.89 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 733 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 109 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  25.95 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.29 
 
 		 470 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  46.43 
 
 		 164 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 555 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.98 
 
 		 233 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  29.14 
 
 		 212 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  56.25 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 754 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.62 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  48.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  46.67 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 567 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  45.61 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0363  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  30.63 
 
 		 624 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0372  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  30.63 
 
 		 624 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 595 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  45.65 
 
 		 560 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  46.67 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  60 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  55.81 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  45.45 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  38.46 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  50 
 
 		 751 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  55.81 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  42.59 
 
 		 143 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.46 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  38.46 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  51.02 
 
 		 230 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  51.16 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.46 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.46 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  38.46 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.46 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  34.86 
 
 		 987 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  39.71 
 
 		 235 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  34.86 
 
 		 987 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  39.68 
 
 		 563 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  48.94 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  38.1 
 
 		 499 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.62 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  43.86 
 
 		 200 aa  47  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  34.72 
 
 		 534 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 204 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  51.16 
 
 		 448 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  48.89 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  32.98 
 
 		 160 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  24.14 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  48.33 
 
 		 312 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  38.82 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  43.1 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  51.85 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  41.67 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2635  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.34 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000028113  unclonable  0.00000000000694269 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 187 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  43.48 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 130 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 797 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.59 
 
 		 727 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  37.78 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.92 
 
 		 637 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>