67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0704 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
411 aa  820    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  34.13 
 
 
221 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0835  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  36.78 
 
 
432 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  38.57 
 
 
538 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  49.09 
 
 
205 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17230  hypothetical protein  27.27 
 
 
245 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
567 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  36.23 
 
 
305 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.54 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
744 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
142 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 
590 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1289  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  47.83 
 
 
330 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  47.73 
 
 
341 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
191 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  42.86 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 
334 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 
207 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1754  hypothetical protein  23.08 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0186256  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1192  hypothetical protein  34.21 
 
 
343 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  41.07 
 
 
257 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  46.81 
 
 
788 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.92 
 
 
727 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.92 
 
 
727 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0068  hypothetical protein  26.42 
 
 
348 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
423 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  47.83 
 
 
739 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 
709 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  46.67 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.61 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.94 
 
 
75 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  40 
 
 
203 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0797  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
579 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.67 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  40.82 
 
 
751 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.65 
 
 
192 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  46 
 
 
733 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  41.18 
 
 
621 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  38.18 
 
 
245 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  47.83 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 
128 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  44.44 
 
 
200 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  41.18 
 
 
587 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1214  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
1130 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  41.18 
 
 
615 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  35.71 
 
 
674 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  41.18 
 
 
609 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
179 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
109 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  32.22 
 
 
185 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000216778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
159 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
698 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  41.67 
 
 
604 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
754 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  41.67 
 
 
613 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1855  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.61 
 
 
208 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.653374  normal  0.622298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  26.09 
 
 
503 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.21 
 
 
295 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  45.45 
 
 
390 aa  43.1  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  41.86 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.48 
 
 
797 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03299  hypothetical protein  31.31 
 
 
338 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>