47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0180 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 567 aa  1178    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0182  hypothetical protein  71.91 
 
 		 172 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.912858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0181  hypothetical protein  86.92 
 
 		 130 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0183  hypothetical protein  73.24 
 
 		 75 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.906264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 368 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  24.21 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  30.77 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  35 
 
 		 212 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 590 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  34.48 
 
 		 324 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 289 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  28.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 327 aa  47.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.3 
 
 		 75 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  50 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  44 
 
 		 179 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 109 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42 
 
 		 304 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.4 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  43.75 
 
 		 384 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.75 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  48.84 
 
 		 399 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 255 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 709 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.75 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.75 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 229 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.75 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  43.75 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.75 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  43.75 
 
 		 315 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  42.86 
 
 		 390 aa  45.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  53.66 
 
 		 733 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  46.51 
 
 		 203 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  51.06 
 
 		 341 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  40 
 
 		 2207 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  40.58 
 
 		 515 aa  43.9  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  38.6 
 
 		 526 aa  43.5  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 1079 aa  43.5  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>