More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1556 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
440 aa  860    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  71.15 
 
 
399 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
390 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  48.63 
 
 
445 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  48.77 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  42.42 
 
 
390 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  37.89 
 
 
390 aa  222  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.76 
 
 
661 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  35.07 
 
 
324 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.98 
 
 
327 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  35.94 
 
 
334 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  35.94 
 
 
334 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 
596 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 
733 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  35.94 
 
 
495 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.81 
 
 
568 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.16 
 
 
1001 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  33.85 
 
 
515 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  34.38 
 
 
515 aa  86.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 
620 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.63 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.38 
 
 
515 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  30.05 
 
 
580 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  31.55 
 
 
602 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  29.78 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
849 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  30.32 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  32.46 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  30.54 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  31.28 
 
 
1021 aa  83.6  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.63 
 
 
304 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.69 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.51 
 
 
617 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.89 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.22 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.27 
 
 
534 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  29.86 
 
 
610 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  32.11 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 
204 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  35.08 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.68 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
797 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  33.16 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  34.85 
 
 
474 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  34.85 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  37.27 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  28.87 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.45 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  29.22 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  24.1 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  38.14 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  38.14 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  41.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  34.85 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  30.39 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  26.73 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.74 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  29.03 
 
 
546 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  29.15 
 
 
1079 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.3 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  22.94 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.3 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.29 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  33.82 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.86 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.88 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  34.64 
 
 
302 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.93 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  30.16 
 
 
173 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 
198 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.52 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  25.79 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.37 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  25.39 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  27.37 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  37.21 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.52 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  29.71 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.62 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.52 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.52 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  27.17 
 
 
695 aa  70.5  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.14 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.81 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
542 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 
527 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  29.32 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  29.32 
 
 
519 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>