198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3686 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  48.11 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  51.61 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  48.65 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  54.9 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  56.86 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  58.82 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  62.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  61.22 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  62.5 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  58.82 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  47.14 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  48.05 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  47.14 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  47.14 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  47.14 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  47.14 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  58.33 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  47.14 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  59.18 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.69 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  57.14 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  57.14 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  61.22 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  61.22 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  58.33 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  58.33 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  46.58 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  46.58 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  57.45 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  48.65 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  57.45 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  51.92 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  55.1 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  53.06 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  55.32 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  49.02 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  44.83 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  54.35 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  54.9 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  44.07 
 
 		 212 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  47.06 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  49.02 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  43.14 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1309 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 440 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  46 
 
 		 440 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 234 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  50.98 
 
 		 1082 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 552 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1623  Peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 232 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000375126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  42.31 
 
 		 228 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  43.33 
 
 		 651 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  46.3 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2902  Peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000393442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  44.23 
 
 		 405 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  42.03 
 
 		 439 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  43.1 
 
 		 1079 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 382 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2195  peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 		 238 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000396131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  48.28 
 
 		 311 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 511 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  44 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 511 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 369 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  35.11 
 
 		 356 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 1051 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 1095 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1787  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 660 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>