19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1371 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 369 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  56.9 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  39.74 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  52.46 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  53.85 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  30.65 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  50.85 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  50.85 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  46.67 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  48.28 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 97 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  39.34 
 
 		 229 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  45.31 
 
 		 440 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  38.71 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  30.51 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  46.03 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  39.13 
 
 		 259 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 503 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>