34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  548  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  38.78 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  47.87 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  39.36 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.56 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  41.82 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  48.53 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  41.59 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  51.61 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  39.47 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  46.67 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  36.46 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 1079 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  42.5 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  44.07 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  40.28 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 572 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  35.94 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  39.71 
 
 		 440 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  39.68 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  40.32 
 
 		 1051 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 1086 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  35.9 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 663 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  44.44 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  38.81 
 
 		 440 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  34.43 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  37.7 
 
 		 167 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  40.62 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 503 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>