75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1442 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 1051 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  50.88 
 
 		 935 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  33.18 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 1086 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1309 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  39.71 
 
 		 420 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1090 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 335 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  35.62 
 
 		 340 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  38.1 
 
 		 390 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 388 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 338 aa  48.5  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  41.54 
 
 		 1124 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  40.85 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  47.76 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  46.55 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  37.88 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 362 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 435 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 374 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 374 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 97 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 368 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 350 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  43.28 
 
 		 411 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 374 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 417 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  34.38 
 
 		 1082 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  46.67 
 
 		 1066 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  43.1 
 
 		 365 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  41.07 
 
 		 377 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  47.06 
 
 		 403 aa  45.1  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 419 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  39.66 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.46 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  33.93 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  45.61 
 
 		 439 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 377 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 1091 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  44.83 
 
 		 335 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  41.33 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  40 
 
 		 353 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 394 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  38.46 
 
 		 311 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 349 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 1079 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  41.82 
 
 		 628 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 		 430 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 389 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  44.23 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  34.72 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 369 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 383 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 394 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  39.29 
 
 		 3151 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  45.07 
 
 		 988 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  45.07 
 
 		 992 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>