36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8210 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  100 
 
 		 1090 aa  2137    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  41.63 
 
 		 1002 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  40.77 
 
 		 969 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  43.91 
 
 		 628 aa  157  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1655 aa  154  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  36.89 
 
 		 564 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  27.72 
 
 		 1091 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.11 
 
 		 1124 aa  139  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  35.86 
 
 		 1385 aa  129  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  36.93 
 
 		 1066 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.09 
 
 		 992 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.8 
 
 		 988 aa  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  31.88 
 
 		 1147 aa  91.3  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 		 1051 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  28.51 
 
 		 1086 aa  82.4  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  39.51 
 
 		 994 aa  79.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  27.89 
 
 		 1041 aa  72.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 1079 aa  72  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1367  SARP family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 963 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  50.91 
 
 		 935 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  31.32 
 
 		 407 aa  62  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  29.77 
 
 		 380 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 		 304 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  34.04 
 
 		 428 aa  48.9  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  45.45 
 
 		 212 aa  48.9  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 503 aa  47.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 680 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 552 aa  47.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 676 aa  46.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  33.8 
 
 		 511 aa  46.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  33.68 
 
 		 217 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  34.67 
 
 		 219 aa  45.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  39.29 
 
 		 404 aa  44.7  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  32.39 
 
 		 511 aa  44.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  39.29 
 
 		 404 aa  44.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>