64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3426 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 1091 aa  2126    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  31.97 
 
 		 1086 aa  342  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1090 aa  208  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  29.26 
 
 		 1051 aa  207  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  27.49 
 
 		 1079 aa  183  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 1066 aa  154  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1002 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  27.58 
 
 		 1385 aa  122  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1655 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.15 
 
 		 1124 aa  98.6  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  29.39 
 
 		 1147 aa  91.3  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  29.97 
 
 		 994 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  29.88 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  28.16 
 
 		 1041 aa  81.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  34.62 
 
 		 969 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  40.32 
 
 		 356 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  32.47 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  34.17 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  32.46 
 
 		 628 aa  72.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3327  peptidoglycan-binding LysM  27.93 
 
 		 1123 aa  71.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.64 
 
 		 992 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  47.14 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  32.79 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.05 
 
 		 988 aa  62.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 334 aa  60.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 161 aa  57.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 242 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  50.88 
 
 		 161 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  50.88 
 
 		 161 aa  56.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  54 
 
 		 677 aa  56.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  27.75 
 
 		 935 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1367  SARP family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 963 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5550  hypothetical protein  25.95 
 
 		 647 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5953  hypothetical protein  25.95 
 
 		 647 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 143 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  45.45 
 
 		 158 aa  51.6  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.49 
 
 		 954 aa  51.6  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 		 97 aa  51.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  42.25 
 
 		 160 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 163 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  44.64 
 
 		 145 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  44.64 
 
 		 145 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  31.97 
 
 		 142 aa  49.7  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  32.39 
 
 		 307 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  48.9  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  48.9  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 1190 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  44.64 
 
 		 166 aa  48.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 154 aa  48.1  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  48.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 153 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  42.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  47.27 
 
 		 156 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 341 aa  47  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  36.11 
 
 		 552 aa  46.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  42.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  45.45 
 
 		 158 aa  46.2  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 		 217 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  34.72 
 
 		 352 aa  45.8  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  40.98 
 
 		 146 aa  45.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  38.67 
 
 		 531 aa  45.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  35.94 
 
 		 148 aa  45.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>