104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2152 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 334 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  61.4 
 
 		 546 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  39.6 
 
 		 1051 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  48.48 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  33.61 
 
 		 1091 aa  62.8  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  51.92 
 
 		 97 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  30.87 
 
 		 1086 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  36.76 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  53.06 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 1066 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  50.91 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  50.91 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  52.17 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  40.32 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  40.68 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  40.68 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  32.28 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  38.05 
 
 		 456 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  54.1 
 
 		 555 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.8 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 552 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 651 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  50.85 
 
 		 551 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  48.08 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  56.52 
 
 		 154 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  29.53 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  52.08 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  47.83 
 
 		 1082 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 153 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  45.45 
 
 		 1217 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  42.31 
 
 		 228 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.19 
 
 		 913 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  56.25 
 
 		 233 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 168 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 511 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 163 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 168 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  44.23 
 
 		 268 aa  49.7  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  31.78 
 
 		 840 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 168 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 1078 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  47.92 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  41.38 
 
 		 667 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  50 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 439 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  52.27 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  38.36 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  40 
 
 		 663 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  51.16 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  51.16 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 158 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.48 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.07 
 
 		 1257 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 146 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 146 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 146 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  48.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  37.1 
 
 		 166 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 161 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  32.74 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  52.11 
 
 		 908 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  44.83 
 
 		 1281 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 150 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  46.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  46.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  46.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  46.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  46.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  40.98 
 
 		 488 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>