16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3327 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3327  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 1123 aa  2150    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1367  SARP family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 963 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  26.47 
 
 		 1051 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  25.51 
 
 		 1086 aa  83.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1066 aa  71.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  26.91 
 
 		 1079 aa  69.3  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  28.05 
 
 		 969 aa  68.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1002 aa  60.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  27.71 
 
 		 1091 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 304 aa  51.6  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 		 1385 aa  50.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  33.12 
 
 		 994 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  40.3 
 
 		 521 aa  46.2  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.38 
 
 		 1124 aa  45.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  41.6 
 
 		 628 aa  45.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  30.92 
 
 		 564 aa  44.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>