31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4135 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  100 
 
 		 1002 aa  1963    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  50.55 
 
 		 969 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  41.12 
 
 		 1090 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  33.12 
 
 		 1385 aa  247  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  46.88 
 
 		 564 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  39.62 
 
 		 1655 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  44.4 
 
 		 628 aa  147  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  28.42 
 
 		 1051 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  30.02 
 
 		 1066 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  33.74 
 
 		 1091 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  28.52 
 
 		 1086 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.45 
 
 		 1124 aa  114  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  27.51 
 
 		 1079 aa  97.8  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 1147 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 1041 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.77 
 
 		 988 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.14 
 
 		 992 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1367  SARP family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 963 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 994 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  27.27 
 
 		 3409 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  29.56 
 
 		 3472 aa  52  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  28.48 
 
 		 3521 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  29.56 
 
 		 3471 aa  51.6  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.92 
 
 		 3210 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 		 304 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  24.62 
 
 		 575 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  28.97 
 
 		 407 aa  45.8  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3327  peptidoglycan-binding LysM  27.86 
 
 		 1123 aa  45.8  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  49.18 
 
 		 715 aa  45.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  38.55 
 
 		 380 aa  44.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>