19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8592 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 		 575 aa  1147    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 935 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6761  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25 
 
 		 735 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.88 
 
 		 988 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.24 
 
 		 992 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 423 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  25.93 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  26.98 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 775 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.08 
 
 		 1126 aa  50.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28 
 
 		 1055 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1002 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  27.49 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.17 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 1004 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  29.6 
 
 		 1068 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  23.67 
 
 		 300 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  26.42 
 
 		 1385 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.03 
 
 		 1013 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>