29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1730 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 988 aa  1879    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  76.8 
 
 		 992 aa  1179    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  27.52 
 
 		 1041 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  30.22 
 
 		 935 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1090 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  33.15 
 
 		 969 aa  111  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1002 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.21 
 
 		 1124 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  34.26 
 
 		 356 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6761  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.23 
 
 		 735 aa  94.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 1066 aa  92  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  33.63 
 
 		 1147 aa  84.7  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  36.57 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  33.05 
 
 		 1091 aa  76.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  30.04 
 
 		 1086 aa  77  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  42.16 
 
 		 1385 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  31.88 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  54.1 
 
 		 1655 aa  67.8  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  28.94 
 
 		 1079 aa  66.6  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  45.71 
 
 		 304 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 		 1051 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  27.07 
 
 		 268 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  33.03 
 
 		 380 aa  51.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  32.68 
 
 		 407 aa  49.3  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1230  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 1124 aa  49.3  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172002  decreased coverage  0.00819992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 261 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 		 746 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  25.51 
 
 		 1068 aa  45.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  38.35 
 
 		 1646 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>