26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2587 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  77.66 
 
 		 988 aa  1154    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 992 aa  1890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 		 1041 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1090 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 935 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.42 
 
 		 1124 aa  109  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  32.88 
 
 		 969 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1002 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6761  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.23 
 
 		 735 aa  94.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  38.83 
 
 		 1066 aa  91.3  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  29.74 
 
 		 356 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  30.58 
 
 		 1147 aa  87  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  28.33 
 
 		 1086 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  32.47 
 
 		 1091 aa  74.7  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 		 1079 aa  74.3  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  34.53 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  30.92 
 
 		 575 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  54.1 
 
 		 1655 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  57.89 
 
 		 1385 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  50.65 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  26.88 
 
 		 1051 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  27.31 
 
 		 268 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1230  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 		 1124 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172002  decreased coverage  0.00819992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  32.64 
 
 		 380 aa  51.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 994 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  44.64 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>