28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4039 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1041 aa  2024    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 		 935 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.95 
 
 		 992 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  34.1 
 
 		 1086 aa  102  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.46 
 
 		 988 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1002 aa  91.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  29.34 
 
 		 1091 aa  87.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  34.32 
 
 		 380 aa  87.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  33.48 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1090 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  32.68 
 
 		 407 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.12 
 
 		 1124 aa  81.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  31.11 
 
 		 969 aa  78.2  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  27.63 
 
 		 1051 aa  72.8  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 		 1066 aa  60.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  39.73 
 
 		 304 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6761  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.57 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  30.13 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  29.63 
 
 		 628 aa  56.6  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1230  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 1124 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172002  decreased coverage  0.00819992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  25.77 
 
 		 1095 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1367  SARP family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 963 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  26.56 
 
 		 1094 aa  48.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  35.42 
 
 		 311 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  26.61 
 
 		 1083 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  37.84 
 
 		 285 aa  45.8  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 156 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>