94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1230 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1230  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 1124 aa  2159    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172002  decreased coverage  0.00819992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 477 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.98 
 
 		 330 aa  64.3  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.47 
 
 		 233 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 466 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 459 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  38.1 
 
 		 334 aa  60.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 229 aa  59.7  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.41 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.07 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  28.78 
 
 		 319 aa  57.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 333 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.07 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 208 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.75 
 
 		 226 aa  57.4  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.09 
 
 		 575 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 271 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.19 
 
 		 356 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 270 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 221 aa  55.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33.82 
 
 		 429 aa  55.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 224 aa  55.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 222 aa  54.7  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 319 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 		 331 aa  54.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 294 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 218 aa  54.3  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  33.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  37.27 
 
 		 222 aa  54.3  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 454 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  38.53 
 
 		 321 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 231 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  34.06 
 
 		 225 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  30.94 
 
 		 352 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 229 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.33 
 
 		 344 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  34.82 
 
 		 572 aa  53.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.04 
 
 		 321 aa  52.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  40.23 
 
 		 327 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.7 
 
 		 218 aa  52.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.33 
 
 		 344 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  32.8 
 
 		 351 aa  52.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.25 
 
 		 209 aa  52.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 471 aa  52.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 		 543 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  39.18 
 
 		 224 aa  52  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.71 
 
 		 172 aa  51.6  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 		 248 aa  51.6  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  34.11 
 
 		 326 aa  51.6  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  32.52 
 
 		 880 aa  51.6  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  43.84 
 
 		 210 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.27 
 
 		 229 aa  51.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  32.67 
 
 		 457 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  43.84 
 
 		 210 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.16 
 
 		 544 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  30.69 
 
 		 466 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.95 
 
 		 992 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 227 aa  50.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  37.5 
 
 		 535 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.1 
 
 		 345 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 310 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 239 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 168 aa  48.9  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 359 aa  48.9  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  49.15 
 
 		 216 aa  48.9  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 		 224 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 264 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 239 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 234 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  48.9  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 		 578 aa  48.5  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  30.58 
 
 		 578 aa  48.5  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  33.75 
 
 		 316 aa  48.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 364 aa  48.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  32.41 
 
 		 327 aa  48.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  34.74 
 
 		 401 aa  48.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 170 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 		 534 aa  47.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.65 
 
 		 542 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.13 
 
 		 344 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.13 
 
 		 344 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 365 aa  46.6  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 227 aa  46.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.57 
 
 		 988 aa  46.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 560 aa  45.8  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 451 aa  45.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 213 aa  44.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  40.3 
 
 		 1066 aa  44.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>