20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6300 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  100 
 
 		 1655 aa  3204    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  51.34 
 
 		 1385 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  38.75 
 
 		 1002 aa  166  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  37.83 
 
 		 1090 aa  157  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  38.77 
 
 		 564 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  41.1 
 
 		 628 aa  134  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  40.38 
 
 		 969 aa  126  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 1091 aa  100  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.05 
 
 		 1124 aa  89  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  35.63 
 
 		 994 aa  85.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  28.73 
 
 		 1079 aa  79.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  31.75 
 
 		 1086 aa  70.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 1147 aa  70.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  55.93 
 
 		 988 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  54.1 
 
 		 992 aa  66.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  54.55 
 
 		 935 aa  62  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  58.49 
 
 		 1066 aa  59.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  56 
 
 		 304 aa  57.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 356 aa  53.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 1051 aa  46.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>