91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1176 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  87.54 
 
 		 680 aa  1088    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 676 aa  1324    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  42.29 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  46.56 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  34.13 
 
 		 546 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  39.37 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  37.72 
 
 		 404 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  37.37 
 
 		 404 aa  163  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  32.03 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 451 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  24.82 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  69.39 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  29.52 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  27.02 
 
 		 322 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  27.76 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  65.31 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  38.26 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  24.91 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  47.06 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  47.69 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  45.1 
 
 		 531 aa  63.9  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  39.47 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  40 
 
 		 440 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  33.75 
 
 		 521 aa  55.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 1051 aa  54.3  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 367 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  26.95 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  46.81 
 
 		 166 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 157 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 167 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  36.17 
 
 		 166 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  38.6 
 
 		 146 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  40.98 
 
 		 364 aa  47.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 395 aa  47.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  42 
 
 		 390 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1090 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 234 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  34.92 
 
 		 148 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 389 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  39.66 
 
 		 158 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 168 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  38 
 
 		 145 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 158 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.09 
 
 		 3552 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  38.3 
 
 		 185 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  42.55 
 
 		 161 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  42.55 
 
 		 161 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 318 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 145 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  39.29 
 
 		 146 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 230 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 		 546 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 150 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 146 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  45.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 146 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 146 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  34.43 
 
 		 168 aa  44.3  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  38.18 
 
 		 628 aa  44.3  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  34.43 
 
 		 168 aa  43.9  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 		 154 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>