105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3691 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
340 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  62.39 
 
 
333 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  61.88 
 
 
335 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  59.24 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  58.6 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  51.5 
 
 
331 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  49.53 
 
 
339 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  38.48 
 
 
333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  31.21 
 
 
440 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 
440 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  30.95 
 
 
440 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  29.82 
 
 
435 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.21 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  28.74 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  28.96 
 
 
395 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  29.1 
 
 
364 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 
388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  27.49 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  28.44 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  28.65 
 
 
349 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  26.24 
 
 
338 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.83 
 
 
389 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  28.25 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  27.34 
 
 
394 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  29.43 
 
 
365 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  26.99 
 
 
390 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  25.61 
 
 
352 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  26.23 
 
 
358 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  26.07 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  28.43 
 
 
374 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  27.15 
 
 
376 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  27.15 
 
 
376 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  27.4 
 
 
369 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  27.15 
 
 
376 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  27.15 
 
 
376 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  27.25 
 
 
369 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  27.87 
 
 
341 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  25.81 
 
 
374 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  29.55 
 
 
362 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  28.2 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  26.69 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  26.99 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  25.54 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  27.48 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  27.32 
 
 
409 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  27.71 
 
 
420 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  27.24 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  26.06 
 
 
408 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  25.66 
 
 
353 aa  95.9  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  27.3 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.79 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  25.44 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  24.43 
 
 
368 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 
405 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  24.43 
 
 
360 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  24.86 
 
 
349 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  24.86 
 
 
349 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  28.88 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  24.69 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  25.43 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  24.93 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  24.62 
 
 
341 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  26.4 
 
 
430 aa  89.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  24.93 
 
 
345 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  27.46 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  22.94 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  25.53 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  23.88 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  26.2 
 
 
391 aa  85.9  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  23.26 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  26.06 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  23.85 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  25.35 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  23.5 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  25.82 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  26.32 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  24.33 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  24.86 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  22.51 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  27.96 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  40.54 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  23.04 
 
 
329 aa  55.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  46.81 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  35.62 
 
 
212 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.88 
 
 
203 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
1051 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  33.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  38.6 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 
143 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  33.96 
 
 
161 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  33.96 
 
 
161 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 
97 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  33.93 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  33.93 
 
 
621 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  34.21 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>