104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4691 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  100 
 
 
1309 aa  2592    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  65.48 
 
 
643 aa  186  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.2 
 
 
913 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  61.15 
 
 
1217 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  57.86 
 
 
1137 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  53.01 
 
 
922 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  52.12 
 
 
1219 aa  145  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  61.95 
 
 
534 aa  141  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  60.19 
 
 
935 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  58.54 
 
 
235 aa  134  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  55.65 
 
 
234 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  44 
 
 
804 aa  96.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  40.28 
 
 
1058 aa  94.7  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.93 
 
 
545 aa  86.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  43.81 
 
 
201 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  38.93 
 
 
1126 aa  85.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  41.46 
 
 
824 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  46.23 
 
 
402 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  42.61 
 
 
224 aa  83.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  42.74 
 
 
192 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  46.49 
 
 
386 aa  82  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  50.5 
 
 
464 aa  80.9  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  47.56 
 
 
1333 aa  80.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  44.17 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  37.59 
 
 
577 aa  79  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  45.12 
 
 
222 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  36.29 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  40.19 
 
 
546 aa  78.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  41.82 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  45.28 
 
 
274 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  41.32 
 
 
607 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  46.99 
 
 
280 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  43.7 
 
 
432 aa  77.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  37.95 
 
 
909 aa  77.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  49.43 
 
 
309 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.28 
 
 
630 aa  75.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  40.19 
 
 
454 aa  74.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  37.42 
 
 
1081 aa  74.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  39.26 
 
 
161 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  44.54 
 
 
239 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.43 
 
 
974 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.24 
 
 
954 aa  73.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  35.09 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.7 
 
 
554 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  47.44 
 
 
1448 aa  71.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  39.13 
 
 
693 aa  71.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  32.64 
 
 
968 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  42.86 
 
 
238 aa  69.7  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  33.78 
 
 
1403 aa  69.7  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  46.84 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  39.6 
 
 
1246 aa  69.3  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  28.83 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  34.21 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  42.68 
 
 
1319 aa  68.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  45.57 
 
 
242 aa  67  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  67.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  40.74 
 
 
258 aa  66.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  45.13 
 
 
243 aa  65.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  44.16 
 
 
313 aa  65.1  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  39.83 
 
 
923 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  41.77 
 
 
1086 aa  64.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  41.98 
 
 
756 aa  64.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  36.04 
 
 
3036 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  36.47 
 
 
1200 aa  62.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  39.47 
 
 
1109 aa  62.4  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  35.22 
 
 
896 aa  61.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  38.96 
 
 
595 aa  61.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  34.57 
 
 
1420 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  38.14 
 
 
569 aa  60.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  36.11 
 
 
1545 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  37.65 
 
 
486 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  33.73 
 
 
1523 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  36.46 
 
 
1202 aa  58.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  36.47 
 
 
1637 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  34.15 
 
 
1060 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  38.38 
 
 
197 aa  57.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  36.47 
 
 
1503 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  33.61 
 
 
866 aa  57  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 
97 aa  55.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  34.43 
 
 
620 aa  55.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  32.12 
 
 
2221 aa  55.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  34.63 
 
 
634 aa  55.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  28.93 
 
 
642 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  36.72 
 
 
448 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0750  hypothetical protein  37.5 
 
 
284 aa  54.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.879908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  40.26 
 
 
466 aa  53.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  37.38 
 
 
723 aa  53.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3796  hypothetical protein  33.02 
 
 
855 aa  53.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  34.15 
 
 
582 aa  52.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  36.47 
 
 
1627 aa  52.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  52.73 
 
 
534 aa  52.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  65 
 
 
1079 aa  52  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  47.06 
 
 
212 aa  51.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  35.06 
 
 
1198 aa  48.5  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
219 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  39.62 
 
 
1082 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.7 
 
 
309 aa  47  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 
304 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  42.59 
 
 
935 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 
234 aa  46.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>