110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1342 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 389 aa  775    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  56.22 
 
 		 220 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  42.21 
 
 		 245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  40.93 
 
 		 244 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  30.42 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  43.04 
 
 		 291 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  40.23 
 
 		 1082 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  28.76 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  41.1 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  27.69 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  27.54 
 
 		 237 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  29.46 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  27.12 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.6 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  30.52 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  29.22 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0628  peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  26.39 
 
 		 259 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  28.71 
 
 		 244 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  27.47 
 
 		 237 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 572 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.83 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  43.66 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1486  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  24.54 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  29.09 
 
 		 167 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  26.42 
 
 		 259 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  37.5 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  39.06 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  38.46 
 
 		 663 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1623  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 232 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000375126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  26.83 
 
 		 243 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  43.55 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  23.89 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.72 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  37.84 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0149  hypothetical protein  39.22 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  23.92 
 
 		 237 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.22 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 97 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  24.86 
 
 		 474 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 255 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 156 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  23.3 
 
 		 228 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  37.33 
 
 		 230 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 156 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 156 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 1051 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  48.39 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 156 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 676 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  42.55 
 
 		 156 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  38.46 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  24.7 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  40.43 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 1910 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 156 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  20.57 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  42.31 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  20.57 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  39.19 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 146 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 195 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  23.97 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  25.45 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 150 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 680 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  23.97 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  45.65 
 
 		 345 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  45.65 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.51 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 1079 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  23.05 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.08 
 
 		 954 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  23.55 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  22.92 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 		 153 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 146 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.89 
 
 		 269 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 146 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  25.35 
 
 		 269 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  23.38 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  38.3 
 
 		 146 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  35.42 
 
 		 166 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>