25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2323 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 309 aa  551  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  36.02 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  35.91 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  62.69 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  45.93 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  36.26 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  53.85 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  60.34 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  56.9 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  53.62 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  56.9 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  50 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  49.33 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  46.91 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1309 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  45.59 
 
 		 212 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  35.14 
 
 		 663 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 1051 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  44.83 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>