17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3805 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  34.27 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  43.93 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  58.93 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  59.26 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  59.26 
 
 		 309 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  46.81 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  46.77 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 369 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  42.5 
 
 		 1079 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  48.44 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  34.85 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  47.17 
 
 		 311 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 1051 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  44 
 
 		 295 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  46.38 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>