18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1756 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  33.59 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  45.87 
 
 
439 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  54.84 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  45.83 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  46.99 
 
 
411 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  34.56 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  43.55 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  49.28 
 
 
309 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  45.59 
 
 
292 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  44.12 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  40.85 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  33.64 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 
219 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  46.38 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  43.06 
 
 
1051 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  36.62 
 
 
1079 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  32.39 
 
 
143 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>