24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1254 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  580  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  49.35 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  60.34 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  57.14 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  50.85 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  47.95 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  46.34 
 
 		 411 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  55.74 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  56.36 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  49.15 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  43.55 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  50.75 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  48.28 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  48.28 
 
 		 97 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 1079 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  47.17 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  54.55 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  39.78 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3327  peptidoglycan-binding LysM  35.05 
 
 		 1123 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  36.17 
 
 		 167 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.46 
 
 		 913 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  38.6 
 
 		 651 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  42.19 
 
 		 1051 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>