16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1787 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1787  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 660 aa  1303    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  48.84 
 
 		 1095 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.58 
 
 		 954 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 97 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2228  Peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 		 319 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00208524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  27.54 
 
 		 663 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  27.14 
 
 		 1091 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  37.21 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 318 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  29.63 
 
 		 185 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  35.85 
 
 		 166 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  35.85 
 
 		 167 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 352 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  28.12 
 
 		 572 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 		 143 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>