72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0262 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
318 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  32.46 
 
 
161 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  32.46 
 
 
161 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  30.7 
 
 
160 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  44.68 
 
 
638 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  35.58 
 
 
187 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  31.63 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  32.26 
 
 
156 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.07 
 
 
954 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  41.94 
 
 
428 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  31.73 
 
 
167 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 
558 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 
552 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  27.42 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  36.73 
 
 
190 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
511 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  30.19 
 
 
145 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
511 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  30.39 
 
 
166 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.67 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 
546 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
451 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
680 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  29.25 
 
 
145 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  52 
 
 
500 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
439 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 
339 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.17 
 
 
233 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  41.3 
 
 
205 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 
5189 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.73 
 
 
627 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 
5236 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  25.29 
 
 
256 aa  45.8  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  34.43 
 
 
663 aa  45.8  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1787  Peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 
660 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  40 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
559 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
676 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  40 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  47.83 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  32.22 
 
 
158 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  35.85 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  36.11 
 
 
572 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  30.11 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  30.11 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  30.11 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
503 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 
591 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  46.81 
 
 
445 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  40.43 
 
 
6272 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 
352 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  29.03 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  30.53 
 
 
168 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 
423 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  44.9 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.92 
 
 
596 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  29.03 
 
 
156 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  30.53 
 
 
168 aa  43.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  35.94 
 
 
168 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  34.62 
 
 
230 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  44.9 
 
 
465 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  38.78 
 
 
456 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.3 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.45 
 
 
429 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 
223 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  42.86 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>