28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2228 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2228  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 319 aa  646    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00208524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  52.94 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0628  peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 1095 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 		 474 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 97 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 1910 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1787  Peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 425 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  43.48 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  40.82 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0582  Peptidoglycan-binding LysM  35.21 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.628153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 		 552 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 158 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  34.55 
 
 		 405 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  30.95 
 
 		 146 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  32.69 
 
 		 511 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  30.16 
 
 		 521 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  32.69 
 
 		 511 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  34.25 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>