64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0582 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0582  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.628153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0367  peptidoglycan-binding LysM  37.56 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.379322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  36.28 
 
 		 235 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  37.86 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0695  Peptidoglycan-binding LysM  34.03 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0706  Peptidoglycan-binding LysM  32.32 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0775900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  39.71 
 
 		 546 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  44.9 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  34 
 
 		 364 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 395 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.4 
 
 		 954 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  35.56 
 
 		 405 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  43.75 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2228  Peptidoglycan-binding LysM  35.21 
 
 		 319 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00208524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 440 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 440 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 440 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 651 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 435 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  31 
 
 		 390 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.75 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  35.71 
 
 		 663 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  37.7 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 1095 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 511 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  39.58 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 572 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  31.65 
 
 		 284 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 451 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  32.54 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 543 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  42.31 
 
 		 456 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.5 
 
 		 334 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  33.85 
 
 		 382 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  34.92 
 
 		 274 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1024 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  41.18 
 
 		 262 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  45.1 
 
 		 148 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 318 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 511 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 349 aa  41.2  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 409 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>