76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2038 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  47.38 
 
 		 1019 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1024 aa  2065    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 1012 aa  569  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1031 aa  513  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  29.85 
 
 		 1005 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1023 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  26.16 
 
 		 1006 aa  347  8.999999999999999e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1004 aa  320  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 1001 aa  292  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  23.12 
 
 		 995 aa  172  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.16 
 
 		 1000 aa  172  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 4079 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 257 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.4 
 
 		 1979 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  23.87 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.1 
 
 		 1694 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.2 
 
 		 938 aa  57.4  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.64 
 
 		 758 aa  56.6  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1069 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.47 
 
 		 1056 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1276 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.71 
 
 		 576 aa  55.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 		 304 aa  55.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.83 
 
 		 586 aa  55.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1138 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.39 
 
 		 707 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 467 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 622 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 264 aa  51.6  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.95 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 250 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 602 aa  51.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 836 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 927 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 		 1056 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 562 aa  50.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 304 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 248 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 269 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  38.14 
 
 		 341 aa  49.3  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21 
 
 		 782 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 585 aa  48.9  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 804 aa  48.5  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.99 
 
 		 573 aa  48.5  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.03 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  30.28 
 
 		 275 aa  48.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 683 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0465  hypothetical protein  24.51 
 
 		 446 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.89 
 
 		 929 aa  47.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 648 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.95 
 
 		 222 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.94 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.11 
 
 		 730 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 572 aa  46.2  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 287 aa  46.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 250 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  27.01 
 
 		 650 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32173  predicted protein  27.31 
 
 		 575 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 350 aa  45.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 265 aa  45.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 593 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 392 aa  45.8  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  21.64 
 
 		 922 aa  45.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.58 
 
 		 161 aa  45.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.68 
 
 		 1022 aa  45.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  32.95 
 
 		 343 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 298 aa  45.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 217 aa  44.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 357 aa  45.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 939 aa  44.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 409 aa  44.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 446 aa  44.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.71 
 
 		 746 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.15 
 
 		 784 aa  44.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  23.78 
 
 		 423 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>