66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00175 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.7 
 
 
1001 aa  945    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  56.53 
 
 
1004 aa  1141    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  100 
 
 
1006 aa  2033    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  30.91 
 
 
1005 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
1023 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
1024 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
1019 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  25.44 
 
 
1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  25.02 
 
 
1012 aa  302  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  21.66 
 
 
995 aa  207  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.85 
 
 
1000 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 
468 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
502 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
4079 aa  54.7  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
927 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.44 
 
 
576 aa  53.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
302 aa  53.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
264 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.93 
 
 
1694 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.81 
 
 
1069 aa  52  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
265 aa  52  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
573 aa  51.6  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.31 
 
 
269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.31 
 
 
269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.31 
 
 
269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.96 
 
 
985 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.44 
 
 
782 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 
689 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  33.33 
 
 
268 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
409 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
883 aa  49.3  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
393 aa  49.3  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1448  tetratricopeptide TPR_2  44.44 
 
 
374 aa  48.9  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  20.5 
 
 
466 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 
265 aa  48.5  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
257 aa  48.5  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 
1297 aa  48.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 
586 aa  48.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.48 
 
 
561 aa  47.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
543 aa  47.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
750 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  29.17 
 
 
266 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
254 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2735  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
453 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00105552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.5 
 
 
573 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 
938 aa  47  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
409 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.09 
 
 
2145 aa  45.8  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.83 
 
 
707 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
393 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 
758 aa  45.8  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.29 
 
 
258 aa  45.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
258 aa  45.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.8 
 
 
890 aa  45.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  20.05 
 
 
395 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  26.95 
 
 
272 aa  45.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4799  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
563 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
631 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  29.29 
 
 
258 aa  45.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.15 
 
 
561 aa  44.7  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.39 
 
 
1009 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
201 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.09 
 
 
340 aa  44.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
824 aa  44.3  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>