86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2246 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1004 aa  2015    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  56.53 
 
 		 1006 aa  1141    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.4 
 
 		 1001 aa  865    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  30.55 
 
 		 1005 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1023 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1019 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1024 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1012 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1031 aa  289  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  22.63 
 
 		 995 aa  218  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.44 
 
 		 1000 aa  175  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.72 
 
 		 1979 aa  66.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 4079 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.92 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.64 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 264 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 393 aa  55.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 1737 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.1 
 
 		 1069 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 393 aa  53.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 883 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 562 aa  53.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 395 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 226 aa  51.2  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 730 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  19.27 
 
 		 468 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 247 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  27.19 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  28.51 
 
 		 276 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 804 aa  49.3  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 568 aa  48.9  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 257 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.74 
 
 		 1694 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 304 aa  48.9  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0235  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 554 aa  48.5  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2413 aa  48.1  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.9 
 
 		 707 aa  48.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 750 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 208 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 593 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 878 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 		 502 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 615 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.62 
 
 		 267 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 199 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21 
 
 		 1421 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.28 
 
 		 938 aa  46.2  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  24.07 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.17 
 
 		 1077 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 332 aa  46.2  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 758 aa  46.2  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2432  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 430 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 356 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  26.92 
 
 		 322 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  19.76 
 
 		 1090 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 		 828 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 573 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 375 aa  45.8  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 		 269 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 		 269 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 		 377 aa  45.8  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 		 269 aa  45.8  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 890 aa  45.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  29.75 
 
 		 889 aa  45.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 466 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 394 aa  45.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 534 aa  45.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.49 
 
 		 462 aa  45.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 296 aa  45.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.02 
 
 		 357 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 245 aa  45.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.24 
 
 		 306 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 634 aa  44.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.19 
 
 		 575 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 565 aa  44.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 279 aa  44.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 201 aa  44.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  24.45 
 
 		 442 aa  44.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 329 aa  44.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>