152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3688 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  37.36 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  35.34 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  26.46 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.36 
 
 		 1979 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 409 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  36.78 
 
 		 573 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 426 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 188 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 495 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 3145 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  25.89 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  40 
 
 		 575 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  25.89 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 409 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 639 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1371 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 942 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 635 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  29.11 
 
 		 160 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.77 
 
 		 746 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 573 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 		 917 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.28 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.53 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 594 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 586 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 923 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  30.86 
 
 		 407 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 571 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 567 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 750 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 		 574 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.53 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 566 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 577 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.71 
 
 		 967 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 883 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 519 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  25.81 
 
 		 143 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 929 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 572 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 		 572 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  28.05 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 544 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01940  karyogamy-related protein, putative  40 
 
 		 886 aa  45.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 409 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 543 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 		 647 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 520 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  26.89 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  23.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  23.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  23.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 614 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  24.84 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 1034 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.36 
 
 		 882 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  23.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  23.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.48 
 
 		 579 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1138 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 866 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 		 619 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.72 
 
 		 643 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1049 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 673 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1004 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2031  zinc finger RanBP2-type  24.29 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>