70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6063 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  76.06 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  68.75 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  57.85 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  60 
 
 		 233 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  59.13 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  60.66 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  48.39 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  35.65 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.58 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  35.4 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 426 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  35.35 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  35.35 
 
 		 428 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  33.91 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  33.75 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  34.62 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 442 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 1979 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 648 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 279 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 328 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  36.56 
 
 		 933 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 589 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 465 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.93 
 
 		 575 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  30.28 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 280 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 617 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 466 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 632 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 592 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 475 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 1061 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  29.59 
 
 		 475 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.57 
 
 		 2240 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 395 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 607 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  34.58 
 
 		 584 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 784 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 725 aa  42  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 564 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 4079 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 593 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 592 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  35.37 
 
 		 106 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 248 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 573 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1127 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.88 
 
 		 661 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 725 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  34.44 
 
 		 824 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 486 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 495 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 436 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  30.59 
 
 		 298 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  26.67 
 
 		 269 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1069 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  26.25 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 277 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  27.47 
 
 		 615 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1104 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 598 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 1129 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>