75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2165 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 137 aa  268  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  68.75 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  69.17 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  55.37 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  61.79 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  58.72 
 
 		 233 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  59.13 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  47.62 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  58.21 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  36.11 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  34.82 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  32.58 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 544 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 426 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  33.91 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 4079 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  26.02 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  32.99 
 
 		 433 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  32.99 
 
 		 428 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 1979 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 543 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.48 
 
 		 560 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  41.98 
 
 		 566 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 442 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 617 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.02 
 
 		 739 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  35.48 
 
 		 933 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 465 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  33.71 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1212 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1276 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  29.25 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 495 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  29.59 
 
 		 475 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 927 aa  43.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 1061 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  30.59 
 
 		 725 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 594 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 695 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1069 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 1073 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  26.36 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 592 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.11 
 
 		 571 aa  42  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  26.72 
 
 		 593 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  27.48 
 
 		 592 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 2240 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 564 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 486 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  33.82 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 632 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 377 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 510 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1450 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.53 
 
 		 707 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 1737 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.17 
 
 		 730 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 326 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  33.8 
 
 		 593 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  34.86 
 
 		 584 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.45 
 
 		 1067 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 328 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 688 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>